RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.19■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.18■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.17■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 AKT1S1Q96B36 256 aa27.17■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 AK7Q96M32 723 aa27.17■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 KCNQ4P56696 695 aa27.16■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.16■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.15■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 NFE2L2Q16236 605 aa27.15■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 IL17REQ8NFR9 667 aa27.15■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 SPON1Q9HCB6 807 aa27.15■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
IMP4-209ENST00000462357 ITGB4P16144 1822 aa27.13■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.13■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.13■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 RUNDC1Q96C34 613 aa27.12■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 MSH5O43196 834 aa27.11■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 ZNF827Q17R98 1081 aa27.11■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.11■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 BTBD11A6QL63 1104 aa27.1■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.09■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 LY75O60449 1722 aa27.09■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.09■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 RIPK4P57078 832 aa27.08■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 MCM10Q7L590 875 aa27.08■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 MTFR1LQ9H019 292 aa27.08■■□□□ 1.93
IMP4-209ENST00000462357 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
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IMP4-209ENST00000462357 MRS2Q9HD23 443 aa27.07■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 SLC39A6Q13433 755 aa27.06■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 ZNF790Q6PG37 636 aa27.06■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.06■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 MRC1P22897 1456 aa27.06■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 SSFA2P28290 1259 aa27.05■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 ITPK1Q13572 414 aa27.05■■□□□ 1.92
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IMP4-209ENST00000462357 STARD3NLO95772 234 aa27.04■■□□□ 1.92
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IMP4-209ENST00000462357 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.04■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.04■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 GNPATO15228 680 aa27.03■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB7AO95365 584 aa27.03■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.03■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.02■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 POLD1P28340 1107 aa27.02■■□□□ 1.92
IMP4-209ENST00000462357 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.01■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 ADRA2BP18089 450 aa27.01■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 DCTN1Q14203 1278 aa27.01■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.01■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 PAPPAQ13219 1627 aa27.01■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 SLC4A9Q96Q91 983 aa27■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
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IMP4-209ENST00000462357 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 RPS6KA4O75676 772 aa26.98■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 PHF14O94880 888 aa26.98■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.98■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
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IMP4-209ENST00000462357 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.97■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.96■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
IMP4-209ENST00000462357 RFC4P35249 363 aa26.95■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.95■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 C5P01031 1676 aa26.95■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.94■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.94■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 C4BP0C0L5 1744 aa26.93■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
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IMP4-209ENST00000462357 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.91■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 CCDC184Q52MB2 194 aa26.9■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 ARXQ96QS3 562 aa26.9■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 LRP5O75197 1615 aa26.9■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 A0A087WZG4 1122 aa26.89■■□□□ 1.9
IMP4-209ENST00000462357 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.89■■□□□ 1.9
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IMP4-209ENST00000462357 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.88■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 ZPR1O75312 459 aa26.88■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.88■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 PTGER2P43116 358 aa26.87■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.87■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.87■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.87■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.86■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 KCNQ3O43525 872 aa26.86■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 CASZ1Q86V15 1759 aa26.86■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
IMP4-209ENST00000462357 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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