RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460330.5

PTGER3-209, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGER3, Length 1,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-209ENST00000460330 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 RREB1Q92766 1687 aa25.43■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 MRC1P22897 1456 aa25.43■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.43■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 KCNQ4P56696 695 aa25.42■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 RIPK4P57078 832 aa25.41■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 TEFQ10587 303 aa25.41■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.4■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 LY75O60449 1722 aa25.4■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.4■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.39■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 NEUROD2Q15784 382 aa25.39■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 MIER1Q8N108 512 aa25.39■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PTGER3-209ENST00000460330 CCER2I3L3R5 266 aa25.37■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 SLC39A6Q13433 755 aa25.37■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.37■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.37■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 APAF1O14727 1248 aa25.37■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 SIK1P57059 783 aa25.37■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 NBPF14Q5TI25 921 aa25.35■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.35■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.34■■□□□ 1.65
PTGER3-209ENST00000460330 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 ATP6V1AP38606 617 aa25.32■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.32■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 BTBD11A6QL63 1104 aa25.31■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 ITPK1Q13572 414 aa25.31■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.3■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF790Q6PG37 636 aa25.3■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 PAPPAQ13219 1627 aa25.3■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 KCNQ3O43525 872 aa25.29■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 SLC15A2Q16348 729 aa25.29■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF827Q17R98 1081 aa25.29■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.29■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 AKT1S1Q96B36 256 aa25.29■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 STK32BQ9NY57 414 aa25.29■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.29■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.27■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.27■■□□□ 1.64
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.24■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 C5P01031 1676 aa25.24■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.24■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.23■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.22■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.21■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.21■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.21■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.2■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 C4BP0C0L5 1744 aa25.2■■□□□ 1.63
PTGER3-209ENST00000460330 CCDC27Q2M243 656 aa25.2■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 AK7Q96M32 723 aa25.19■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 TJP1Q07157 1748 aa25.18■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 WWC1Q8IX03 1113 aa25.18■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.18■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.18■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 CHL1O00533 1208 aa25.17■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.17■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.17■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.16■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.16■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.15■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 GNPATO15228 680 aa25.15■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 SMIM5Q71RC9 77 aa25.15■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 CFAP44Q96MT7 982 aa25.15■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PTGER3-209ENST00000460330 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF853P0CG23 659 aa25.13■■□□□ 1.61
PTGER3-209ENST00000460330 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PTGER3-209ENST00000460330 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTGER3-209ENST00000460330 USP16Q9Y5T5 823 aa25.12■■□□□ 1.61
PTGER3-209ENST00000460330 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.12■■□□□ 1.61
PTGER3-209ENST00000460330 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTGER3-209ENST00000460330 PHF14O94880 888 aa25.12■■□□□ 1.61
PTGER3-209ENST00000460330 STARD3NLO95772 234 aa25.12■■□□□ 1.61
PTGER3-209ENST00000460330 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.12■■□□□ 1.61
PTGER3-209ENST00000460330 IFT57Q9NWB7 429 aa25.12■■□□□ 1.61
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