RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
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RABGEF1-210ENST00000437078 MCCP23508 829 aa16.58■□□□□ 0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
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RABGEF1-210ENST00000437078 PIK3R4Q99570 1358 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX58O95786 925 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 GORABQ5T7V8 394 aa16.48■□□□□ 0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBTB3Q9H5J0 574 aa16.47■□□□□ 0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 RTL1A6NKG5 1358 aa16.47■□□□□ 0.23
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RABGEF1-210ENST00000437078 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.46■□□□□ 0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.46■□□□□ 0.23
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