RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa17.06■□□□□ 0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
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PTPRU-204ENST00000428026 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 PTPRKQ15262 1439 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRU-204ENST00000428026 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
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