RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HERC3-205ENST00000426683 MRC1P22897 1456 aa23.95■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 ATP6V1AP38606 617 aa23.95■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 IL17REQ8NFR9 667 aa23.95■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.95■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.95■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.95■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 ITPK1Q13572 414 aa23.93■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 C5P01031 1676 aa23.92■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 CASZ1Q86V15 1759 aa23.91■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.91■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 TEFQ10587 303 aa23.91■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.91■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.91■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.9■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 ANP32CO43423 234 aa23.9■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB7AO95365 584 aa23.9■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 SLC39A6Q13433 755 aa23.9■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 LRP5O75197 1615 aa23.89■■□□□ 1.42
HERC3-205ENST00000426683 AK7Q96M32 723 aa23.89■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 SPON1Q9HCB6 807 aa23.89■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.89■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 MCM10Q7L590 875 aa23.88■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 C4BP0C0L5 1744 aa23.87■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.87■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 DCTN1Q14203 1278 aa23.87■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 NFE2L2Q16236 605 aa23.87■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 MTFR1LQ9H019 292 aa23.85■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.85■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 MSH5O43196 834 aa23.84■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.84■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.84■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.84■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.83■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.83■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 CCDC184Q52MB2 194 aa23.83■■□□□ 1.41
HERC3-205ENST00000426683 BTBD11A6QL63 1104 aa23.82■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 GNPATO15228 680 aa23.82■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 PHF14O94880 888 aa23.82■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.82■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.82■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.82■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.82■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 ZNF790Q6PG37 636 aa23.81■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 SMIM5Q71RC9 77 aa23.81■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.81■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.81■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 RUNDC1Q96C34 613 aa23.8■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 SSFA2P28290 1259 aa23.79■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 PTGER2P43116 358 aa23.79■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 RIPK4P57078 832 aa23.79■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.79■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.78■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 TJP1Q07157 1748 aa23.77■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 KCNQ3O43525 872 aa23.77■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
HERC3-205ENST00000426683 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 MRS2Q9HD23 443 aa23.76■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 RPS6KA4O75676 772 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 NEUROD2Q15784 382 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.75■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.74■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.73■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 MSL1Q68DK7 614 aa23.73■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.73■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 POLD1P28340 1107 aa23.72■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.72■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 ADRA2BP18089 450 aa23.71■■□□□ 1.39
HERC3-205ENST00000426683 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 STARD3NLO95772 234 aa23.69■■□□□ 1.38
HERC3-205ENST00000426683 ARXQ96QS3 562 aa23.69■■□□□ 1.38
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