RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.2■■□□□ 1.3
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANXA1P04083 346 aa23.11■■□□□ 1.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.11■■□□□ 1.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.11■■□□□ 1.29
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEGF6O75095 1541 aa23.09■■□□□ 1.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASC1Q6TDU7 716 aa23.09■■□□□ 1.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSH3Q8TE77 659 aa23.09■■□□□ 1.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.08■■□□□ 1.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSE1Q14687 1217 aa23.07■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.07■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.06■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MX1P20591 662 aa23.05■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLA2Q14181 598 aa23.05■■□□□ 1.28
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PROSER3Q2NL68 480 aa23.05■■□□□ 1.28
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