RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP6V1AP38606 617 aa33.32■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC52A2Q9HAB3 445 aa33.32■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 SPON1Q9HCB6 807 aa33.32■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 LRP5O75197 1615 aa33.31■■■□□ 2.92
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HTATSF1-202ENST00000425695 GNAT3A8MTJ3 354 aa33.31■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 C5P01031 1676 aa33.3■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP3K5Q99683 1374 aa33.3■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 TAF1LQ8IZX4 1826 aa33.3■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 ITPK1Q13572 414 aa33.29■■■□□ 2.92
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HTATSF1-202ENST00000425695 LINC00116Q8NCU8 138 aa33.28■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa33.28■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 IL17REQ8NFR9 667 aa33.27■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC4A9Q96Q91 983 aa33.27■■■□□ 2.92
HTATSF1-202ENST00000425695 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa33.25■■■□□ 2.91
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HTATSF1-202ENST00000425695 SLC39A6Q13433 755 aa33.24■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 AK7Q96M32 723 aa33.24■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 NEFMP07197 916 aa33.23■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 C4BP0C0L5 1744 aa33.22■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 SMIM5Q71RC9 77 aa33.22■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa33.22■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 TEFQ10587 303 aa33.21■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 MTFR1LQ9H019 292 aa33.21■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 MRC1P22897 1456 aa33.2■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 QSER1Q2KHR3 1735 aa33.2■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHF1Q96S99 279 aa33.2■■■□□ 2.91
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
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HTATSF1-202ENST00000425695 MCM10Q7L590 875 aa33.17■■■□□ 2.9
HTATSF1-202ENST00000425695 PTGER2P43116 358 aa33.16■■■□□ 2.9
HTATSF1-202ENST00000425695 DCTN1Q14203 1278 aa33.16■■■□□ 2.9
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC16A10Q8TF71 515 aa33.16■■■□□ 2.9
HTATSF1-202ENST00000425695 GNPATO15228 680 aa33.15■■■□□ 2.9
HTATSF1-202ENST00000425695 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa33.15■■■□□ 2.9
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP33.13■■■□□ 2.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa33.12■■■□□ 2.89
HTATSF1-202ENST00000425695 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 UBR3Q6ZT12 1888 aa33.11■■■□□ 2.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF831Q5JPB2 1677 aa33.1■■■□□ 2.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
HTATSF1-202ENST00000425695 KCPQ6ZWJ8 1503 aa33.07■■■□□ 2.88
HTATSF1-202ENST00000425695 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa33.06■■■□□ 2.88
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HTATSF1-202ENST00000425695 KCNQ3O43525 872 aa33.05■■■□□ 2.88
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC184Q52MB2 194 aa33.03■■■□□ 2.88
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HTATSF1-202ENST00000425695 RPS6KA4O75676 772 aa33.02■■■□□ 2.88
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HTATSF1-202ENST00000425695 UBR2Q8IWV8 1755 aa33■■■□□ 2.87
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HTATSF1-202ENST00000425695 NEUROD2Q15784 382 aa32.99■■■□□ 2.87
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
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HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC87Q9NVE4 849 aa32.98■■■□□ 2.87
HTATSF1-202ENST00000425695 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
HTATSF1-202ENST00000425695 HEG1Q9ULI3 1381 aa32.96■■■□□ 2.87
HTATSF1-202ENST00000425695 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
HTATSF1-202ENST00000425695 KLHL34Q8N239 644 aa32.96■■■□□ 2.87
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HTATSF1-202ENST00000425695 COL24A1Q17RW2 1714 aa32.94■■■□□ 2.86
HTATSF1-202ENST00000425695 ADRA2BP18089 450 aa32.94■■■□□ 2.86
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