RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
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SFTA3-201ENST00000418548 CHL1O00533 1208 aa18.73■□□□□ 0.59
SFTA3-201ENST00000418548 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
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SFTA3-201ENST00000418548 TEFQ10587 303 aa18.7■□□□□ 0.58
SFTA3-201ENST00000418548 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
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SFTA3-201ENST00000418548 BTBD11A6QL63 1104 aa18.65■□□□□ 0.58
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SFTA3-201ENST00000418548 DOT1LQ8TEK3 1739 aa18.61■□□□□ 0.57
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SFTA3-201ENST00000418548 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF790Q6PG37 636 aa18.61■□□□□ 0.57
SFTA3-201ENST00000418548 KCNQ3O43525 872 aa18.6■□□□□ 0.57
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SFTA3-201ENST00000418548 SLC39A6Q13433 755 aa18.59■□□□□ 0.57
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SFTA3-201ENST00000418548 KCNQ2O43526 872 aa18.57■□□□□ 0.56
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SFTA3-201ENST00000418548 KRT24Q2M2I5 525 aa18.55■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 UBR2Q8IWV8 1755 aa18.55■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.54■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.53■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 KCPQ6ZWJ8 1503 aa18.53■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 PTF1AQ7RTS3 328 aa18.52■□□□□ 0.56
SFTA3-201ENST00000418548 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
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SFTA3-201ENST00000418548 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.51■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.5■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 BTAF1O14981 1849 aa18.5■□□□□ 0.55
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SFTA3-201ENST00000418548 CACNA1FO60840 1977 aa18.49■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.48■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 TRIM37O94972 964 aa18.47■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.47■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 PALLDQ8WX93 1383 aa18.46■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.46■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.46■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.46■□□□□ 0.55
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF831Q5JPB2 1677 aa18.45■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa18.45■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 BCAR3O75815 825 aa18.45■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 SIK1P57059 783 aa18.45■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.45■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 USP16Q9Y5T5 823 aa18.45■□□□□ 0.54
SFTA3-201ENST00000418548 C5P01031 1676 aa18.44■□□□□ 0.54
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