RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SDSP20132 328 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC4A2P04920 1241 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 AK9Q5TCS8 1911 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ATF3P18847 181 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 PTMSP20962 102 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA0232Q92628 1395 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPRCP08575 1304 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC4A10Q6U841 1118 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 LTN1O94822 1766 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 F6X3S4 739 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 CASC1Q6TDU7 716 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 NWD1Q149M9 1564 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 CLCN1P35523 988 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 G2E3Q7L622 706 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 GCP02774 474 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 CRB1P82279 1406 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.95■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF4Q96M43 638 aa22.95■■□□□ 1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 PKP1Q13835 747 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 MCTP1Q6DN14 999 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 HMMRO75330 724 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 NUCB2P80303 420 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF10O15013 1369 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ST18O60284 1047 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ERBB4Q15303 1308 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ESPNB1AK53 854 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 REC8O95072 547 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 NECTIN2Q92692 538 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 MST1RQ04912 1400 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 NFAT5O94916 1531 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 ERC2O15083 957 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRNA2Q15822 529 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE1AP54750 535 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 STRCQ7RTU9 1775 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3BP1-202ENST00000417536 IP6K1Q92551 441 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 KDRP35968 1356 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 GNAI2P04899 355 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 STK31Q9BXU1 1019 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 RGPD5Q99666 1765 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 IL17REQ8NFR9 667 aa22.83■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 NEK4P51957 841 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 FLIIQ13045 1269 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 LGR6Q9HBX8 967 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 BRINP3Q76B58 766 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 RILPL2Q969X0 211 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 MX1P20591 662 aa22.79■■□□□ 1.24
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