RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRKAR2BP31323 418 aa13.71□□□□□ -0.21
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.21
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RSPH6AQ9H0K4 717 aa13.71□□□□□ -0.21
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMOD3Q9NYL9 352 aa13.71□□□□□ -0.21
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NUDCQ9Y266 331 aa13.71□□□□□ -0.21
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MRC1P22897 1456 aa13.71□□□□□ -0.21
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KCNQ4P56696 695 aa13.7□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NBPF14Q5TI25 921 aa13.7□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PIGBQ92521 554 aa13.7□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DCAF5Q96JK2 942 aa13.7□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.7□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRP5O75197 1615 aa13.7□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 QSER1Q2KHR3 1735 aa13.7□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AKAP4Q5JQC9 854 aa13.69□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DLG5Q8TDM6 1919 aa13.68□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C4BP0C0L5 1744 aa13.68□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF827Q17R98 1081 aa13.68□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MAP3K5Q99683 1374 aa13.68□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ERVV-2B6SEH9 535 aa13.67□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CABP4P57796 275 aa13.67□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC27A3Q5K4L6 730 aa13.67□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PHACTR3Q96KR7 559 aa13.67□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 STK32BQ9NY57 414 aa13.67□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GAS2L2Q8NHY3 880 aa13.66□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ASAP1Q9ULH1 1129 aa13.66□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TJP1Q07157 1748 aa13.66□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC15A2Q16348 729 aa13.65□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LGR6Q9HBX8 967 aa13.65□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATG3Q9NT62 314 aa13.65□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF831Q5JPB2 1677 aa13.65□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBR2Q8IWV8 1755 aa13.65□□□□□ -0.22
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBR3Q6ZT12 1888 aa13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FCHSD2O94868 740 aa13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa13.64□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GNAT3A8MTJ3 354 aa13.63□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa13.63□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC52A2Q9HAB3 445 aa13.63□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KCPQ6ZWJ8 1503 aa13.63□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa13.62□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SIK1P57059 783 aa13.62□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AKT1S1Q96B36 256 aa13.62□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.61□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa13.6□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ITPK1Q13572 414 aa13.6□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00116Q8NCU8 138 aa13.6□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PLEKHF1Q96S99 279 aa13.6□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa13.6□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZBTB7AO95365 584 aa13.59□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NEFMP07197 916 aa13.59□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATP6V1AP38606 617 aa13.59□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC39A6Q13433 755 aa13.59□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IL17REQ8NFR9 667 aa13.59□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLC4A9Q96Q91 983 aa13.59□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa13.59□□□□□ -0.23
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANP32CO43423 234 aa13.58□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TEFQ10587 303 aa13.58□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DCTN1Q14203 1278 aa13.58□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MCM10Q7L590 875 aa13.58□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.58□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C4AP0C0L4 1744 aa13.58□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.58□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL24A1Q17RW2 1714 aa13.57□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC184Q52MB2 194 aa13.57□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AMIGO3Q86WK7 504 aa13.57□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AK7Q96M32 723 aa13.57□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NFE2L2Q16236 605 aa13.56□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMIM5Q71RC9 77 aa13.56□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PHF14O94880 888 aa13.55□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ADAMTS8Q9UP79 889 aa13.55□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LAMB4A4D0S4 1761 aa13.54□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GNPATO15228 680 aa13.54□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MTFR1LQ9H019 292 aa13.54□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPON1Q9HCB6 807 aa13.54□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DNAJC10Q8IXB1 793 aa13.53□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TTC5Q8N0Z6 440 aa13.53□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa13.53□□□□□ -0.24
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BTBD11A6QL63 1104 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms