RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 HMMRO75330 724 aa25.2■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 PXDNQ92626 1479 aa25.2■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.2■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 MEIS3Q99687 375 aa25.2■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.19■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 COL18A1P39060 1754 aa25.19■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.18■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.18■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 GNAI3P08754 354 aa25.18■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 TEFQ10587 303 aa25.18■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.17■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.17■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 CPDO75976 1380 aa25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 LGR6Q9HBX8 967 aa25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 GNAI2P04899 355 aa25.15■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 RGPD5Q99666 1765 aa25.15■■□□□ 1.62
SUMO3-204ENST00000411651 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.14■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 F6X3S4 739 aa25.14■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.14■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.13■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.13■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 BTBD11A6QL63 1104 aa25.12■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.1■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 STRCQ7RTU9 1775 aa25.1■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.08■■□□□ 1.61
SUMO3-204ENST00000411651 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.08■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 NBR1Q14596 966 aa25.07■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 SLC4A3P48751 1232 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 HSPA2P54652 639 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 CDC45O75419 566 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 TTC22Q5TAA0 569 aa25.06■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 ATP8B2P98198 1209 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 SPG7Q9UQ90 795 aa25.05■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 MRC1P22897 1456 aa25.04■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 BRINP3Q76B58 766 aa25.03■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.02■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 NECTIN2Q92692 538 aa25.02■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.02■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 USP44Q9H0E7 712 aa25.02■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.02■■□□□ 1.6
SUMO3-204ENST00000411651 MEGF6O75095 1541 aa25.01■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.01■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 KCNQ3O43525 872 aa25■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 PHKG2P15735 406 aa24.99■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.98■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 BEND3Q5T5X7 828 aa24.98■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 SNX21Q969T3 373 aa24.98■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.98■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 SSH3Q8TE77 659 aa24.97■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 HYPKQ9NX55 129 aa24.97■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.96■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.96■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 ADCY9O60503 1353 aa24.96■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.96■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 ALDH1L1O75891 902 aa24.96■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.96■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHG5O94827 1062 aa24.95■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 DCAF5Q96JK2 942 aa24.95■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.94■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.94■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 POLA2Q14181 598 aa24.94■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 NFKBIBQ15653 356 aa24.94■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF790Q6PG37 636 aa24.94■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 CASC1Q6TDU7 716 aa24.94■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.94■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.94■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.93■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 RAB11FIP3O75154 756 aa24.93■■□□□ 1.58
SUMO3-204ENST00000411651 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
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