RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 CCDC30Q5VVM6 783 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 GNAI3P08754 354 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.07■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 FLIIQ13045 1269 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 MCTP1Q6DN14 999 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 CLCN1P35523 988 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.06■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 NLRP6P59044 892 aa16.05■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 NECTIN2Q92692 538 aa16.04■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 MCCP23508 829 aa16.03■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 MX1P20591 662 aa16.03■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 ATP8B2P98198 1209 aa16.02■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 TSHZ3Q63HK5 1081 aa16.02■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PRAME-201ENST00000398741 KCNA6P17658 529 aa16.02■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 HOXC9P31274 260 aa16.02■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 PKP1Q13835 747 aa16.02■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.01■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 ESPNB1AK53 854 aa16.01■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.01■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 NASPP49321 788 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa16.01■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 MAP3K5Q99683 1374 aa16.01■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 NEK4P51957 841 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 RILPL2Q969X0 211 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 SALL3Q9BXA9 1300 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 MCM2P49736 904 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 PIK3C2AO00443 1686 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 LRRC37A3O60309 1634 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 IL17REQ8NFR9 667 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 HSPA2P54652 639 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 ZNF445P59923 1031 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 ABTB2Q8N961 1025 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 CHMLP26374 656 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 TMX3Q96JJ7 454 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 ANAPC15P60006 121 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 C14orf37Q86TY3 774 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 STAP2Q9UGK3 403 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-201ENST00000398741 USP44Q9H0E7 712 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 AOX1Q06278 1338 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 ERBB4Q15303 1308 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 PPP1R9BQ96SB3 815 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 AK9Q5TCS8 1911 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 PALD1Q9ULE6 856 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 NWD1Q149M9 1564 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 RAB11FIP3O75154 756 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 SSH3Q8TE77 659 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 STRCQ7RTU9 1775 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 SURF6O75683 361 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 CUL4AQ13619 759 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 GPT2Q8TD30 523 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-201ENST00000398741 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms