RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.67■■□□□ 1.38
UPP1-203ENST00000395564 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
UPP1-203ENST00000395564 MCM10Q7L590 875 aa23.65■■□□□ 1.38
UPP1-203ENST00000395564 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
UPP1-203ENST00000395564 NEUROD2Q15784 382 aa23.65■■□□□ 1.38
UPP1-203ENST00000395564 DCTN1Q14203 1278 aa23.64■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 NGEFQ8N5V2 710 aa23.64■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.64■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.63■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.63■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 CCDC27Q2M243 656 aa23.62■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 PALLDQ8WX93 1383 aa23.61■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 ATG3Q9NT62 314 aa23.61■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 LY75O60449 1722 aa23.6■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.6■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 PAPPAQ13219 1627 aa23.59■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.58■■□□□ 1.37
UPP1-203ENST00000395564 BTBD11A6QL63 1104 aa23.57■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 TXNRD1Q16881 649 aa23.57■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.57■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 RREB1Q92766 1687 aa23.57■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 PROM2Q8N271 834 aa23.56■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 ZNF790Q6PG37 636 aa23.55■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.54■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.53■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 SIK1P57059 783 aa23.53■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 SLC39A6Q13433 755 aa23.53■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 WWC1Q8IX03 1113 aa23.53■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.53■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.53■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
UPP1-203ENST00000395564 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.51■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.5■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.5■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 CFAP44Q96MT7 982 aa23.5■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.5■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.49■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 CHL1O00533 1208 aa23.49■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 ATP6V1AP38606 617 aa23.49■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 WDR63Q8IWG1 891 aa23.49■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.49■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 IFT57Q9NWB7 429 aa23.49■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 IL16Q14005 1332 aa23.48■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 GNAI1P63096 354 aa23.48■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.48■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 ZNF853P0CG23 659 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 KCNQ3O43525 872 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-203ENST00000395564 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 ZNF521Q96K83 1311 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 C5P01031 1676 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 ITPK1Q13572 414 aa23.44■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 NBPF14Q5TI25 921 aa23.44■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 KCNQ4P56696 695 aa23.43■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 TJP1Q07157 1748 aa23.43■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 MBIPQ9NS73 344 aa23.41■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 C4BP0C0L5 1744 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 AKT1S1Q96B36 256 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 STK32BQ9NY57 414 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-203ENST00000395564 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 SLC15A2Q16348 729 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 STARD3NLO95772 234 aa23.38■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 GOLGA2Q08379 1002 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 ZNF827Q17R98 1081 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 AK7Q96M32 723 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 HOXB7P09629 217 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 USP16Q9Y5T5 823 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 E9PSI1 815 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-203ENST00000395564 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms