RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395560.7

UPP1-202, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 955 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-202ENST00000395560 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
UPP1-202ENST00000395560 GNAI1P63096 354 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-202ENST00000395560 IFT57Q9NWB7 429 aa23.29■■□□□ 1.32
UPP1-202ENST00000395560 TRIM37O94972 964 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-202ENST00000395560 CFAP44Q96MT7 982 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-202ENST00000395560 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
UPP1-202ENST00000395560 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.28■■□□□ 1.32
UPP1-202ENST00000395560 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
UPP1-202ENST00000395560 BCL9O00512 1426 aa23.26■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 MRC1P22897 1456 aa23.26■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 ZNF853P0CG23 659 aa23.26■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 SLFN5Q08AF3 891 aa23.26■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.26■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 RREB1Q92766 1687 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 CABP4P57796 275 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.25■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 CHL1O00533 1208 aa23.24■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.24■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.22■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.21■■□□□ 1.31
UPP1-202ENST00000395560 BTBD11A6QL63 1104 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.19■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.19■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 ITGB4P16144 1822 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 APBA3O96018 575 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 MBIPQ9NS73 344 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
UPP1-202ENST00000395560 ZNF790Q6PG37 636 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 PIGBQ92521 554 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 SBF2Q86WG5 1849 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 NHSQ6T4R5 1651 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 PAPPAQ13219 1627 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 KCNQ2O43526 872 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 SLC39A6Q13433 755 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 ZNF428Q96B54 188 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 ATG3Q9NT62 314 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-202ENST00000395560 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 HOXB7P09629 217 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 KCNQ3O43525 872 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.05■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.04■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 BTAF1O14981 1849 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.03■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 VAMP4O75379 141 aa23.02■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UPP1-202ENST00000395560 TSPYL6Q8N831 410 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 PALLDQ8WX93 1383 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 KRT24Q2M2I5 525 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 CASZ1Q86V15 1759 aa22.99■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 PROM2Q8N271 834 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.98■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.97■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 SIK1P57059 783 aa22.96■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
UPP1-202ENST00000395560 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.95■■□□□ 1.26
UPP1-202ENST00000395560 PLSCR1O15162 318 aa22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms