RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, human

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GKAP1-204	ENST00000388782	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
GKAP1-204	ENST00000388782	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GKAP1-204	ENST00000388782	EP400	Q96L91	3159 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GKAP1-204	ENST00000388782	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
GKAP1-204	ENST00000388782	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	32.39	■■■□□ 2.78
GKAP1-204	ENST00000388782	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GKAP1-204	ENST00000388782	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
GKAP1-204	ENST00000388782	BTAF1	O14981	1849 aa		32.39	■■■□□ 2.78
GKAP1-204	ENST00000388782	PIGB	Q92521	554 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GKAP1-204	ENST00000388782	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
GKAP1-204	ENST00000388782	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GKAP1-204	ENST00000388782	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GKAP1-204	ENST00000388782	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GKAP1-204	ENST00000388782	IL16	Q14005	1332 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	GNAI1	P63096	354 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	APBA3	O96018	575 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		32.26	■■■□□ 2.76
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	CHL1	O00533	1208 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	PLSCR1	O15162	318 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	BAG6	P46379	1132 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	LY75	O60449	1722 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GKAP1-204	ENST00000388782	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		32.19	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.19	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782		E9PSI1	815 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	KCNQ3	O43525	872 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	SIK1	P57059	783 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GKAP1-204	ENST00000388782	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	SLFN5	Q08AF3	891 aa		32.12	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	RREB1	Q92766	1687 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	TJP1	Q07157	1748 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.08	■■■□□ 2.73
GKAP1-204	ENST00000388782	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	C5	P01031	1676 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	PROM2	Q8N271	834 aa		32.05	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	HOXB7	P09629	217 aa		32.04	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	ITPK1	Q13572	414 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.01	■■■□□ 2.72
GKAP1-204	ENST00000388782	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GKAP1-204	ENST00000388782	STARD3NL	O95772	234 aa		32	■■■□□ 2.71
GKAP1-204	ENST00000388782	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32	■■■□□ 2.71
GKAP1-204	ENST00000388782	KCNQ4	P56696	695 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GKAP1-204	ENST00000388782	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
GKAP1-204	ENST00000388782	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GKAP1-204	ENST00000388782	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GKAP1-204	ENST00000388782	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		31.98	■■■□□ 2.71

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