RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 G2E3Q7L622 706 aa19.58■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.58■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.57■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.57■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 PKD1L3Q7Z443 1732 aa19.56■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 IL2RBP14784 551 aa19.56■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.56■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.56■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa19.55■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.55■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 SLC39A6Q13433 755 aa19.54■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.54■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 ABCC4O15439 1325 aa19.53■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa19.52■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC30Q5VVM6 783 aa19.52■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 DCAF5Q96JK2 942 aa19.52■□□□□ 0.72
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa19.52■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa19.51■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 STK31Q9BXU1 1019 aa19.51■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 RGS12O14924 1447 aa19.51■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 AAMPQ13685 434 aa19.5■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 CERKQ8TCT0 537 aa19.5■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 F6X3S4 739 aa19.5■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 CACNA1FO60840 1977 aa19.49■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.49■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa19.49■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa19.49■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 SHANK3Q9BYB0 1731 aa19.49■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 CABP4P57796 275 aa19.48■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF790Q6PG37 636 aa19.48■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 PTPRCP08575 1304 aa19.48■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 HEG1Q9ULI3 1381 aa19.47■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 ANXA1P04083 346 aa19.47■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 FLIIQ13045 1269 aa19.47■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf115Q9H7X2 142 aa19.47■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 PLCH1Q4KWH8 1693 aa19.47■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 CHPF2Q9P2E5 772 aa19.46■□□□□ 0.71
CASQ1-201ENST00000368078 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 HOXB7P09629 217 aa19.45■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.45■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.44■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 ERVV-2B6SEH9 535 aa19.42■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 PROSER3Q2NL68 480 aa19.42■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 MRC1P22897 1456 aa19.41■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 NRAPQ86VF7 1730 aa19.41■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 DISP2A7MBM2 1401 aa19.41■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.41■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa19.4■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 USP16Q9Y5T5 823 aa19.4■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 C5P01031 1676 aa19.39■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 EXOC5O00471 708 aa19.39■□□□□ 0.7
CASQ1-201ENST00000368078 JCADQ9P266 1359 aa19.39■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 RGS3P49796 1198 aa19.39■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 C8orf37Q96NL8 207 aa19.39■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 MEIS3Q99687 375 aa19.39■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 PDIA6Q15084 440 aa19.38■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 SIRT2Q8IXJ6 389 aa19.38■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 NGLY1Q96IV0 654 aa19.38■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa19.38■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 HSPA1LP34931 641 aa19.37■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.37■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 SLIT2O94813 1529 aa19.37■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 CCT4P50991 539 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.37■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa19.36■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa19.36■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 CHMP4AQ9BY43 222 aa19.36■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.35■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.35■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 UNC5CLQ8IV45 518 aa19.35■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 PIGBQ92521 554 aa19.35■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 WNK3Q9BYP7 1800 aa19.34■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 NWD2Q9ULI1 1742 aa19.34■□□□□ 0.69
CASQ1-201ENST00000368078 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms