RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.82■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 DDX11Q96FC9 970 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 MYD88Q99836 296 aa23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 PDCL3Q9H2J4 239 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 F6X3S4 739 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 HYPKQ9NX55 129 aa23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRCP08575 1304 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K11Q16584 847 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.79■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 SMTNL1A8MU46 457 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM27P14373 513 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 FERMT3Q86UX7 667 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 GRIN2AQ12879 1464 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 KIF14Q15058 1648 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.78■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 FLIIQ13045 1269 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 MPNDQ8N594 471 aa23.77■■□□□ 1.4
CCSAP-203ENST00000366687 CUL7Q14999 1698 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 NAPBQ9H115 298 aa23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K12Q12852 859 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 ERLIN2O94905 339 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 ESPNB1AK53 854 aa23.74■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 PIP4K2BP78356 416 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 NOS1P29475 1434 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087WZG4 1122 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC181Q5TID7 509 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 ZPR1O75312 459 aa23.72■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 IL16Q14005 1332 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 SYCE3A1L190 88 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 H0YHG0 523 aa23.71■■□□□ 1.39
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF76P36508 570 aa23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 ERLIN1O75477 346 aa23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 USP5P45974 858 aa23.7■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP100Q494V2 611 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf76Q96K31 380 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 IQCA1Q86XH1 822 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 SLC5A1P13866 664 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF213O14771 459 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 EVI5LQ96CN4 794 aa23.68■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC66A2RUB6 948 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 ANO10Q9NW15 660 aa23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO3Q9UK99 471 aa23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms