RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364072.1

RNU6-501P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 501, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-501P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP17L21D6R901 530 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP17L18D6R9N7 530 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP17L22D6RA61 530 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP17L19D6RCP7 530 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP17L20D6RJB6 530 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP17L24Q0WX57 530 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC102BQ68D86 513 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 NLRP3Q96P20 1036 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF358Q9NW07 568 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 CENPCQ03188 943 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF787Q6DD87 383 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 MAN1A2O60476 641 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 ARID3AQ99856 593 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 ATG7O95352 703 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 SMTNP53814 917 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 TLR1Q15399 786 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 ARXQ96QS3 562 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-501P-201ENST00000364072 SFI1A8K8P3 1242 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 BACH1O14867 736 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 DPYDQ12882 1025 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 MTFR1Q15390 333 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 A6NJY4 79 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 M0R2N6 131 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 EPHA4P54764 986 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 SEC13P55735 322 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 USP3Q9Y6I4 520 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 RHOQP17081 205 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 FOXK2Q01167 660 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 TNS4Q8IZW8 715 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 CDK2AP1O14519 115 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 PTSQ03393 145 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 POU4F2Q12837 409 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 NBPF15Q8N660 670 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 C4orf17Q53FE4 359 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 WDR44Q5JSH3 913 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 GNASQ5JWF2 1037 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 STK32AQ8WU08 396 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC35F4A4IF30 521 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 FAM69CQ0P6D2 419 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 LGR5O75473 907 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 PHKA2P46019 1235 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 TBCELQ5QJ74 424 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 HINFPQ9BQA5 517 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 C21orf2O43822 256 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 PLA2G4AP47712 749 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 CABP1Q9NZU7 370 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 PPFIA3O75145 1194 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 TEAD4Q15561 434 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 POTEAQ6S8J7 498 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 IGFBP4P22692 258 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 WEE1P30291 646 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-501P-201ENST00000364072 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms