RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 BTBD11A6QL63 1104 aa22.47■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.46■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.45■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 USP54Q70EL1 1684 aa22.45■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.44■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 RGS12O14924 1447 aa22.44■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.44■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.44■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 ALS2Q96Q42 1657 aa22.43■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 DCCP43146 1447 aa22.43■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 SLC4A3P48751 1232 aa22.43■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 STK31Q9BXU1 1019 aa22.43■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 FLIIQ13045 1269 aa22.42■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.42■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.42■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 FAM161AQ3B820 660 aa22.41■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 KIF1AQ12756 1690 aa22.41■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.41■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 PROSER3Q2NL68 480 aa22.41■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.41■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.41■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 MEGF6O75095 1541 aa22.4■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 CYP27B1O15528 508 aa22.39■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PDE4D-204ENST00000358923 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.38■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.38■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.36■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 SMC5Q8IY18 1101 aa22.35■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 PHKG2P15735 406 aa22.34■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 PIP4K2BP78356 416 aa22.34■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PDE4D-204ENST00000358923 AAMPQ13685 434 aa22.33■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.32■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 EVA1CP58658 441 aa22.32■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 PTPRCP08575 1304 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 MYL6BP14649 208 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 NUCB1Q02818 461 aa22.3■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 CEP85Q6P2H3 762 aa22.3■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC37A3O60309 1634 aa22.3■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 BTG4Q9NY30 223 aa22.29■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.29■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 ADAMTS2O95450 1211 aa22.29■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 COL18A1P39060 1754 aa22.28■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 SPG7Q9UQ90 795 aa22.28■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF790Q6PG37 636 aa22.27■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.27■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.27■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.27■■□□□ 1.16
PDE4D-204ENST00000358923 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.26■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.26■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 USP16Q9Y5T5 823 aa22.26■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 NCAPD2Q15021 1401 aa22.26■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.25■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 ATP10DQ9P241 1426 aa22.25■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 USP44Q9H0E7 712 aa22.24■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.23■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 CPDO75976 1380 aa22.23■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 CABP4P57796 275 aa22.22■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.21■■□□□ 1.15
PDE4D-204ENST00000358923 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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