RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.69□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP47Q96K76 1375 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STRCQ7RTU9 1775 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NR6A1Q15406 480 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C8orf37Q96NL8 207 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KDM4AO75164 1064 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC34A2O95436 690 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STAC3Q96MF2 364 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EID1Q9Y6B2 187 aa8.68□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FDX1P10109 184 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOSBP53539 338 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SULF1Q8IWU6 871 aa8.67□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L3A6NCW0 530 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L4A6NCW7 530 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MROH2AA6NES4 1674 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.66□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SOX11P35716 441 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADGRB3O60242 1522 aa8.65□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POTEB2H3BUK9 544 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LTKP29376 864 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSKSQ9UJT2 592 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PIK3C2BO00750 1634 aa8.64□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RDH13Q8NBN7 331 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L15C9J2P7 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L10C9JJH3 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L12C9JPN9 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L11C9JVI0 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L21D6R901 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L18D6R9N7 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L22D6RA61 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L19D6RCP7 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L20D6RJB6 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L24Q0WX57 530 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POGKQ9P215 609 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTMR2Q13614 643 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL9A1P20849 921 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP17L5A8MUK1 530 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NLRP1Q9C000 1473 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMF1P82094 1093 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTK7Q13308 1070 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYOM2P54296 1465 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXO45P0C2W1 286 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VAMP1P23763 118 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PIK3C2GO75747 1445 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM196BA6NMK8 535 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP2B4P23634 1241 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBXN4Q92575 508 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJB2P25686 324 aa8.59□□□□□ -1.03
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