RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 SLC4A3P48751 1232 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 POTEB2H3BUK9 544 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 CABP1Q9NZU7 370 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 MX1P20591 662 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 HYPKQ9NX55 129 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM266Q2M3C6 531 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 CETN1Q12798 172 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K11Q16584 847 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 CAVIN4Q5BKX8 364 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 FAM107BQ9H098 131 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC83Q8IWF9 413 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 TAF4BQ92750 862 aa7.02□□□□□ -1.28
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 BACH2Q9BYV9 841 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 FOSBP53539 338 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TSG101Q99816 390 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 KIF5BP33176 963 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TRAF1Q13077 416 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 DDX11Q96FC9 970 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CASTP20810 708 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 MCM5P33992 734 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SPA17Q15506 151 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 STRN4Q9NRL3 753 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K12Q12852 859 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 IL16Q14005 1332 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CD109Q6YHK3 1445 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 GSDMDP57764 484 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 RNF214Q8ND24 703 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 PLB1Q6P1J6 1458 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 A0A087WZG4 1122 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CUL5Q93034 780 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 BMP15O95972 392 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC183Q5T5S1 534 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 GOLIM4O00461 696 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TAOK3Q9H2K8 898 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ZPR1O75312 459 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 RAI14Q9P0K7 980 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 PIK3R4Q99570 1358 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TUBB4AP04350 444 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 KANK3Q6NY19 840 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 FANCAO15360 1455 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF76P36508 570 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 NUP133Q8WUM0 1156 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 FERMT1Q9BQL6 677 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 TMOD3Q9NYL9 352 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 SLC5A1P13866 664 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC172P0C7W6 258 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA1328Q86T90 577 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL34Q8N239 644 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 USP37Q86T82 979 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 ANO10Q9NW15 660 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-201ENST00000356100 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms