RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324394.7

ZNF404-201, Transcript of zinc finger protein 404, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF404, Length 1,844 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404-201ENST00000324394 ADH1CP00326 375 aa7.37□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 SMPD1P17405 629 aa7.37□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.37□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.37□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.37□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.37□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.36□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 NR3C2P08235 984 aa7.36□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 OCLNQ16625 522 aa7.36□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.36□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 HINFPQ9BQA5 517 aa7.36□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.35□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 LILRA1O75019 489 aa7.35□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 NR5A1Q13285 461 aa7.34□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF358Q9NW07 568 aa7.34□□□□□ -1.23
ZNF404-201ENST00000324394 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 SCNN1DP51172 638 aa7.34□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 SERPINB4P48594 390 aa7.33□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.33□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 ALDH1A1P00352 501 aa7.32□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 GDF10P55107 478 aa7.32□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 M0R2N6 131 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 RGS22Q8NE09 1264 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 WEE1P30291 646 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 TNS4Q8IZW8 715 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 MTMR7Q9Y216 660 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 INHAP05111 366 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 KCNMA1Q12791 1236 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 NNTQ13423 1086 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 H3BM21 787 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 GNRH1P01148 92 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 CCDC27Q2M243 656 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 J3QL48 77 aa7.28□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 EPHA4P54764 986 aa7.28□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 CBLBQ13191 982 aa7.28□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 TRIM52Q96A61 297 aa7.28□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.28□□□□□ -1.24
ZNF404-201ENST00000324394 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 BACH1O14867 736 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 HPS1Q92902 700 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ITPKCQ96DU7 683 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 SEPT3Q9UH03 358 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 C21orf2O43822 256 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ABL1P00519 1130 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 IL2RAP01589 272 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 IGFBP4P22692 258 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 TBCELQ5QJ74 424 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ADH1AP07327 375 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 CNKSR1Q969H4 720 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 ERBB4Q15303 1308 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 A0A1W2PRU2 124 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 A6NJY4 79 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 SMTNP53814 917 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 MTMR3Q13615 1198 aa7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ZNF404-201ENST00000324394 Q6ZVU0 165 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms