RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316436.3

LSMEM2-201, Transcript of leucine rich single-pass membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LSMEM2, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSMEM2-201ENST00000316436 SBF2Q86WG5 1849 aa20.7■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 CHL1O00533 1208 aa20.69■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 EP400Q96L91 3159 aa20.69■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 NHSQ6T4R5 1651 aa20.69■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 A0A0G2JS52 829 aa20.69■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 GNAI1P63096 354 aa20.69■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 MYT1Q01538 1121 aa20.69■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.69■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.69■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.68■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 C5P01031 1676 aa20.66■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 TEFQ10587 303 aa20.66■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.65■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 BCL9O00512 1426 aa20.65■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.65■□□□□ 0.9
LSMEM2-201ENST00000316436 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.64■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.64■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 KCNQ3O43525 872 aa20.63■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 FAM182BQ5T319 152 aa20.63■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 RXRBP28702 533 aa20.62■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 KRT24Q2M2I5 525 aa20.62■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.62■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 BTAF1O14981 1849 aa20.62■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 SOCS7O14512 581 aa20.62■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 CABP4P57796 275 aa20.62■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 BTBD11A6QL63 1104 aa20.61■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC39A6Q13433 755 aa20.6■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 TSPYL6Q8N831 410 aa20.6■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.6■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.6■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.59■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.59■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 PIGBQ92521 554 aa20.59■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.59■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.58■□□□□ 0.89
LSMEM2-201ENST00000316436 KCNQ2O43526 872 aa20.57■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.57■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.57■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 TJP1Q07157 1748 aa20.57■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF790Q6PG37 636 aa20.56■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.54■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 VAMP4O75379 141 aa20.53■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 ATG3Q9NT62 314 aa20.53■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 LY75O60449 1722 aa20.53■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.52■□□□□ 0.88
LSMEM2-201ENST00000316436 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.51■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.51■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.5■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.48■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.48■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.48■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 PALLDQ8WX93 1383 aa20.47■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 BCAR3O75815 825 aa20.47■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.47■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.47■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 RREB1Q92766 1687 aa20.46■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.46■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 HOXB7P09629 217 aa20.46■□□□□ 0.87
LSMEM2-201ENST00000316436 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 CACNA1FO60840 1977 aa20.44■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.44■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF428Q96B54 188 aa20.43■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 TRIM37O94972 964 aa20.43■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.43■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 NECTIN2Q92692 538 aa20.43■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.42■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.42■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.42■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 USP16Q9Y5T5 823 aa20.41■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.4■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.4■□□□□ 0.86
LSMEM2-201ENST00000316436 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.39■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 SIK1P57059 783 aa20.39■□□□□ 0.85
LSMEM2-201ENST00000316436 ITPK1Q13572 414 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms