RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.65■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.65■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 MRC1P22897 1456 aa28.65■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.64■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 CABP4P57796 275 aa28.64■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.64■■■□□ 2.17
CTU2-201ENST00000312060 ITGB4P16144 1822 aa28.63■■■□□ 2.17
CTU2-201ENST00000312060 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CTU2-201ENST00000312060 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CTU2-201ENST00000312060 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CTU2-201ENST00000312060 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CTU2-201ENST00000312060 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.59■■■□□ 2.17
CTU2-201ENST00000312060 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU2-201ENST00000312060 TSPYL6Q8N831 410 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU2-201ENST00000312060 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.58■■■□□ 2.17
CTU2-201ENST00000312060 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 KRT24Q2M2I5 525 aa28.58■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 KCNQ3O43525 872 aa28.56■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 VAMP4O75379 141 aa28.56■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.55■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 SLC39A6Q13433 755 aa28.54■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 ZNF790Q6PG37 636 aa28.54■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.53■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 ZNF428Q96B54 188 aa28.52■■■□□ 2.16
CTU2-201ENST00000312060 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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CTU2-201ENST00000312060 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.51■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 PIGBQ92521 554 aa28.51■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 BCAR3O75815 825 aa28.5■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 RXRBP28702 533 aa28.5■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.49■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 PAPPAQ13219 1627 aa28.48■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.48■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.48■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 BCL9O00512 1426 aa28.48■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.47■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.47■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.47■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.46■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.45■■■□□ 2.15
CTU2-201ENST00000312060 CACNA1FO60840 1977 aa28.45■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 FAM182BQ5T319 152 aa28.45■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 POTEAQ6S8J7 498 aa28.45■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 HOXB7P09629 217 aa28.44■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.44■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 SBF2Q86WG5 1849 aa28.44■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.43■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.42■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 ATG3Q9NT62 314 aa28.42■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 KCNQ2O43526 872 aa28.4■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 PLIN1O60240 522 aa28.4■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.4■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 C5P01031 1676 aa28.4■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.39■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.39■■■□□ 2.14
CTU2-201ENST00000312060 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 NEFLP07196 543 aa28.38■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.38■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.38■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 NECTIN2Q92692 538 aa28.38■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 NHSQ6T4R5 1651 aa28.37■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
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CTU2-201ENST00000312060 STK31Q9BXU1 1019 aa28.35■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.35■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 RGS12O14924 1447 aa28.35■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 BTAF1O14981 1849 aa28.34■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 SLC4A2P04920 1241 aa28.34■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 KIF16BQ96L93 1317 aa28.34■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.33■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CTU2-201ENST00000312060 USP16Q9Y5T5 823 aa28.32■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.32■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.31■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.3■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 FKBP8Q14318 412 aa28.29■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.29■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.28■■■□□ 2.12
CTU2-201ENST00000312060 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
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