RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 TRERF1Q96PN7 1200 aa17.28■□□□□ 0.36
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PTPRN-201ENST00000295718 ZNF165P49910 485 aa17.16■□□□□ 0.34
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PTPRN-201ENST00000295718 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-201ENST00000295718 DNAJC25Q9H1X3 360 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ME1P48163 572 aa17.16■□□□□ 0.34
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PTPRN-201ENST00000295718 KIF1BPQ96EK5 621 aa17.16■□□□□ 0.34
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