RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292377.3

GPC2-201, Transcript of glypican 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC2, Length 2,532 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2-201ENST00000292377 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.81■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 CHRNA2Q15822 529 aa22.8■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 BTBD11A6QL63 1104 aa22.8■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.79■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.79■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 ERBB3P21860 1342 aa22.79■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.79■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.79■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.78■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 KIF1AQ12756 1690 aa22.77■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.77■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.77■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GPC2-201ENST00000292377 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.76■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 ALS2Q96Q42 1657 aa22.76■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.76■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.75■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 NCAPD2Q15021 1401 aa22.74■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 GNAI2P04899 355 aa22.74■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.74■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.73■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.73■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.73■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.72■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 USP44Q9H0E7 712 aa22.72■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.72■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.71■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 BECN1Q14457 450 aa22.71■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 NFKBIBQ15653 356 aa22.71■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.71■■□□□ 1.23
GPC2-201ENST00000292377 PROSER3Q2NL68 480 aa22.7■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.7■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.69■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.69■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 SLC39A6Q13433 755 aa22.69■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.69■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 DCCP43146 1447 aa22.69■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 BRINP3Q76B58 766 aa22.69■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 HMMRO75330 724 aa22.68■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 TTC22Q5TAA0 569 aa22.68■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 GNAI3P08754 354 aa22.68■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.68■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 CACNA1FO60840 1977 aa22.68■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.67■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.67■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 ATP8B2P98198 1209 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 MEGF6O75095 1541 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.65■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 CDC45O75419 566 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 HOXB7P09629 217 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.64■■□□□ 1.22
GPC2-201ENST00000292377 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 SDSP20132 328 aa22.63■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.63■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 PHKG2P15735 406 aa22.63■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 BEND3Q5T5X7 828 aa22.63■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 COL18A1P39060 1754 aa22.63■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 ADCY9O60503 1353 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 KIF2CQ99661 725 aa22.62■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.61■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 CYP27B1O15528 508 aa22.6■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 SLAIN2Q9P270 581 aa22.6■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 STRCQ7RTU9 1775 aa22.6■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.6■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 PDE1AP54750 535 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 ZNF790Q6PG37 636 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 USP35Q9P2H5 1018 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 SPG7Q9UQ90 795 aa22.59■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.58■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.58■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.58■■□□□ 1.21
GPC2-201ENST00000292377 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GPC2-201ENST00000292377 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms