RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 NESP48681 1621 aa13.93□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 FBLN1P23142 703 aa13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 USP8P40818 1118 aa13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 CABLES1Q8TDN4 633 aa13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 ERLIN2O94905 339 aa13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 DUSP27Q5VZP5 1158 aa13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 CKAP2LQ8IYA6 745 aa13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC113Q9H0I3 377 aa13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 FERMT3Q86UX7 667 aa13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 ACBD3Q9H3P7 528 aa13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.92□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 CCT2P78371 535 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 ST5P78524 1137 aa13.91□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.91□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF20AO95235 890 aa13.91□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC7Q96M83 1385 aa13.91□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA1328Q86T90 577 aa13.91□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 ANXA1P04083 346 aa13.91□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC5A1P13866 664 aa13.9□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP6V1AP38606 617 aa13.9□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 HAND2P61296 217 aa13.9□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.9□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 NBPF4Q96M43 638 aa13.9□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP13.9□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 ISM2Q6H9L7 571 aa13.9□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 GOPCQ9HD26 462 aa13.9□□□□□ -0.18
UBASH3B-201ENST00000284273 RBM10P98175 930 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 SPATA32Q96LK8 384 aa13.9□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 MYO1BO43795 1136 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC83Q8IWF9 413 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 PRKG1Q13976 671 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 AKNAD1Q5T1N1 836 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 FERMT2Q96AC1 680 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 PANK2Q9BZ23 570 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 JMYQ8N9B5 988 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 HSPA2P54652 639 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 SP4Q02446 784 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 BICD1Q96G01 975 aa13.89□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 SYNJ2O15056 1496 aa13.88□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 NLRP5P59047 1200 aa13.88□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM212AQ96EL1 285 aa13.88□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 GOLGA6L10A6NI86 522 aa13.88□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 EP400NLQ6ZTU2 488 aa13.87□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC191Q8NCU4 936 aa13.87□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.87□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.87□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 SMARCA4P51532 1647 aa13.87□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 NAIPQ13075 1403 aa13.87□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A087WZG4 1122 aa13.87□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa13.87□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CDKL5O76039 1030 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAK2O60296 914 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC178Q5BJE1 867 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CPLX3Q8WVH0 158 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 SERPINA10Q9UK55 444 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 POTEJP0CG39 1038 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 PDCP20941 246 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM43AQ8N2R8 423 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC150Q8NCX0 1101 aa13.86□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 MAP3K12Q12852 859 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CTNNA3Q9UI47 895 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF287Q9HBT7 754 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CABP5Q9NP86 173 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 AKAP2Q9Y2D5 859 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 GOLIM4O00461 696 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD1Q15327 319 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CHD1LQ86WJ1 897 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 SYCP3Q8IZU3 236 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM57Q8N5G2 664 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC39Q9UFE4 941 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC12A7Q9Y666 1083 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CFTRP13569 1480 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CALRP27797 417 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 ATP2B3Q16720 1220 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 TCERG1LQ5VWI1 586 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 SKAP1Q86WV1 359 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 RGS22Q8NE09 1264 aa13.85□□□□□ -0.19
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBTB9Q96C00 473 aa13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms