RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 FGD1P98174 961 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-201ENST00000272602 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-201ENST00000272602 MYRIPQ8NFW9 859 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-201ENST00000272602 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-201ENST00000272602 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.09□□□□□ -0.31
CNGA3-201ENST00000272602 WWC3Q9ULE0 1092 aa13.08□□□□□ -0.31
CNGA3-201ENST00000272602 CHMP3Q9Y3E7 222 aa13.08□□□□□ -0.31
CNGA3-201ENST00000272602 NPHP1O15259 732 aa13.08□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 SLC39A6Q13433 755 aa13.08□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 TRPM2O94759 1503 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 KCNQ4P56696 695 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 DRC7Q8IY82 874 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 ANKRD24Q8TF21 1146 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 BTG4Q9NY30 223 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 VGLL3A8MV65 326 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 TOM1O60784 492 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 ADCY5O95622 1261 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 ATP2B3Q16720 1220 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC27Q2M243 656 aa13.07□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 PHF14O94880 888 aa13.06□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 REC8O95072 547 aa13.06□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 PDE4CQ08493 712 aa13.06□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.06□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 MADDQ8WXG6 1647 aa13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 GLI2P10070 1586 aa13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 EYA1Q99502 592 aa13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 RICTORQ6R327 1708 aa13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 DTNBO60941 627 aa13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 MYL6BP14649 208 aa13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF592Q92610 1267 aa13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 USP26Q9BXU7 913 aa13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.05□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 RILPL2Q969X0 211 aa13.04□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.04□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.04□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 TET3O43151 1660 aa13.04□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 PRIMPOLQ96LW4 560 aa13.04□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 ABCC11Q96J66 1382 aa13.04□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 FIBPO43427 364 aa13.04□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 TSPYL6Q8N831 410 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 TMX3Q96JJ7 454 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 KIF1BO60333 1816 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 SDSP20132 328 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 BRINP3Q76B58 766 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 NBPF4Q96M43 638 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 ZDHHC9Q9Y397 364 aa13.03□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 PTPRUQ92729 1446 aa13.02□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 CFAP44Q96MT7 982 aa13.02□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CNGA3-201ENST00000272602 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.02□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 SYNMO15061 1565 aa13.02□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 TTC22Q5TAA0 569 aa13.02□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.02□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 PIK3C2BO00750 1634 aa13.02□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 MCCP23508 829 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 PIBF1Q8WXW3 757 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 IFT57Q9NWB7 429 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 NPHP3Q7Z494 1330 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 UNC13BO14795 1591 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.01□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 ERC2O15083 957 aa13□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 ZBTB22O15209 634 aa13□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 CLEC17AQ6ZS10 378 aa13□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 USP48Q86UV5 1035 aa13□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 KLHL34Q8N239 644 aa13□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 TRERF1Q96PN7 1200 aa13□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 TAOK2Q9UL54 1235 aa13□□□□□ -0.33
CNGA3-201ENST00000272602 ERICH4A6NGS2 130 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms