RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.41■■□□□ 1.82
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.4■■□□□ 1.82
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC39A6Q13433 755 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BTBD11A6QL63 1104 aa26.33■■□□□ 1.81
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.32■■□□□ 1.8
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 GNAI1P63096 354 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ILDR2Q71H61 639 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATG3Q9NT62 314 aa26.28■■□□□ 1.8
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF790Q6PG37 636 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT24Q2M2I5 525 aa26.24■■□□□ 1.79
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 BTAF1O14981 1849 aa26.21■■□□□ 1.79
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.17■■□□□ 1.78
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNQ4P56696 695 aa26.16■■□□□ 1.78
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.13■■□□□ 1.77
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.07■■□□□ 1.76
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.06■■□□□ 1.76
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