RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252813.5

PGPEP1-201, Transcript of pyroglutamyl-peptidase I, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGPEP1, Length 1,409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1-201ENST00000252813 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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PGPEP1-201ENST00000252813 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.31■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 RREB1Q92766 1687 aa20.3■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.3■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.3■□□□□ 0.84
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PGPEP1-201ENST00000252813 TEFQ10587 303 aa20.29■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 NFE2L2Q16236 605 aa20.29■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 CCDC184Q52MB2 194 aa20.29■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.29■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 SLC39A6Q13433 755 aa20.28■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 ITPK1Q13572 414 aa20.28■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 MCM10Q7L590 875 aa20.28■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.28■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.28■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 DCTN1Q14203 1278 aa20.27■□□□□ 0.84
PGPEP1-201ENST00000252813 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1-201ENST00000252813 ITGB4P16144 1822 aa20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1-201ENST00000252813 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1-201ENST00000252813 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1-201ENST00000252813 RUNDC1Q96C34 613 aa20.26■□□□□ 0.83
PGPEP1-201ENST00000252813 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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PGPEP1-201ENST00000252813 BTBD11A6QL63 1104 aa20.23■□□□□ 0.83
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PGPEP1-201ENST00000252813 ZBTB7AO95365 584 aa20.22■□□□□ 0.83
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PGPEP1-201ENST00000252813 ZNF790Q6PG37 636 aa20.22■□□□□ 0.83
PGPEP1-201ENST00000252813 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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PGPEP1-201ENST00000252813 SPON1Q9HCB6 807 aa20.22■□□□□ 0.83
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PGPEP1-201ENST00000252813 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PGPEP1-201ENST00000252813 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.21■□□□□ 0.83
PGPEP1-201ENST00000252813 MRS2Q9HD23 443 aa20.21■□□□□ 0.83
PGPEP1-201ENST00000252813 LY75O60449 1722 aa20.21■□□□□ 0.83
PGPEP1-201ENST00000252813 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.2■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 KCNQ3O43525 872 aa20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 NEUROD2Q15784 382 aa20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 SMIM5Q71RC9 77 aa20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 MRC1P22897 1456 aa20.19■□□□□ 0.82
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PGPEP1-201ENST00000252813 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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PGPEP1-201ENST00000252813 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.17■□□□□ 0.82
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PGPEP1-201ENST00000252813 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.16■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.16■□□□□ 0.82
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PGPEP1-201ENST00000252813 PHF14O94880 888 aa20.15■□□□□ 0.82
PGPEP1-201ENST00000252813 SSFA2P28290 1259 aa20.15■□□□□ 0.82
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PGPEP1-201ENST00000252813 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.1■□□□□ 0.81
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PGPEP1-201ENST00000252813 USP16Q9Y5T5 823 aa20.1■□□□□ 0.81
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PGPEP1-201ENST00000252813 RFC4P35249 363 aa20.08■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.08■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa20.07■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 CHL1O00533 1208 aa20.07■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 MSL1Q68DK7 614 aa20.07■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.07■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 A1BGP04217 495 aa20.06■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 POLD1P28340 1107 aa20.06■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 ARXQ96QS3 562 aa20.06■□□□□ 0.8
PGPEP1-201ENST00000252813 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.06■□□□□ 0.8
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