RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HTATSF1-201ENST00000218364 STAP2Q9UGK3 403 aa27■■□□□ 1.91
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HTATSF1-201ENST00000218364 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.97■■□□□ 1.91
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HTATSF1-201ENST00000218364 NUTM2FA1L443 756 aa26.92■■□□□ 1.9
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HTATSF1-201ENST00000218364 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.88■■□□□ 1.89
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HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHG5O94827 1062 aa26.85■■□□□ 1.89
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HTATSF1-201ENST00000218364 RAB11FIP3O75154 756 aa26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPY26PQ9H489 355 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 PIK3C2AO00443 1686 aa26.81■■□□□ 1.88
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HTATSF1-201ENST00000218364 NWD1Q149M9 1564 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 IL17REQ8NFR9 667 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K5Q99683 1374 aa26.81■■□□□ 1.88
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