RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
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ANKRD54-201ENST00000215941 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
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ANKRD54-201ENST00000215941 HMMRO75330 724 aa27.9■■■□□ 2.06
ANKRD54-201ENST00000215941 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
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ANKRD54-201ENST00000215941 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
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ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM63CQ9P1W3 806 aa27.82■■■□□ 2.04
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ANKRD54-201ENST00000215941 TMX3Q96JJ7 454 aa27.79■■■□□ 2.04
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ANKRD54-201ENST00000215941 DCTN1Q14203 1278 aa27.75■■■□□ 2.03
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ANKRD54-201ENST00000215941 KRT24Q2M2I5 525 aa27.65■■■□□ 2.02
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM87AQ8NBN3 555 aa27.65■■■□□ 2.02
ANKRD54-201ENST00000215941 MX1P20591 662 aa27.64■■■□□ 2.02
ANKRD54-201ENST00000215941 CACNA1FO60840 1977 aa27.64■■■□□ 2.01
ANKRD54-201ENST00000215941 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
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ANKRD54-201ENST00000215941 FAM13BQ9NYF5 915 aa27.63■■■□□ 2.01
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