RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.45■■□□□ 1.51
SLC25A3-201ENST00000188376 NECTIN2Q92692 538 aa24.45■■□□□ 1.51
SLC25A3-201ENST00000188376 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 STK31Q9BXU1 1019 aa24.45■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.45■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 PIP4K2BP78356 416 aa24.44■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.44■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 PTPRCP08575 1304 aa24.44■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 CYP27B1O15528 508 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 TOM1O60784 492 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 RGS12O14924 1447 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 G2E3Q7L622 706 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 BTG4Q9NY30 223 aa24.43■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 MYT1Q01538 1121 aa24.41■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.4■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 CACNA1FO60840 1977 aa24.4■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.39■■□□□ 1.5
SLC25A3-201ENST00000188376 IL2RBP14784 551 aa24.39■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 DCAF5Q96JK2 942 aa24.39■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 USP35Q9P2H5 1018 aa24.38■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 HOXB7P09629 217 aa24.37■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.37■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.36■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.36■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 FLIIQ13045 1269 aa24.35■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.34■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 F6X3S4 739 aa24.34■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.34■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC39A6Q13433 755 aa24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 MRC1P22897 1456 aa24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SLC25A3-201ENST00000188376 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.33■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 ADAMTS2O95450 1211 aa24.32■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 RGS3P49796 1198 aa24.32■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF790Q6PG37 636 aa24.32■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.32■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.32■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.31■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.31■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 CABP4P57796 275 aa24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.27■■□□□ 1.48
SLC25A3-201ENST00000188376 ANXA1P04083 346 aa24.26■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 C5P01031 1676 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 MEIS3Q99687 375 aa24.25■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 SMC5Q8IY18 1101 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 PDE4AP27815 886 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 DISP2A7MBM2 1401 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 PROSER3Q2NL68 480 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 NRAPQ86VF7 1730 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.21■■□□□ 1.47
SLC25A3-201ENST00000188376 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.2■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 ATP10DQ9P241 1426 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 BACH2Q9BYV9 841 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.18■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 HYPKQ9NX55 129 aa24.17■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 PDIA6Q15084 440 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 CEP85Q6P2H3 762 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 GCC1Q96CN9 775 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 USP16Q9Y5T5 823 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 ADCY9O60503 1353 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 GLI3P10071 1580 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC25A3-201ENST00000188376 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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