RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 FERMT3Q86UX7 667 aa15.71■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.71■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 POLKQ9UBT6 870 aa15.71■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.71■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 STX6O43752 255 aa15.7■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC192P0DO97 292 aa15.7■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 OGFRQ9NZT2 677 aa15.7■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 MCM10Q7L590 875 aa15.7■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 LUZP1Q86V48 1076 aa15.7■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC83Q8IWF9 413 aa15.7■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 TPM3P06753 285 aa15.69■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.69■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 SYT1P21579 422 aa15.69■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 CHMLP26374 656 aa15.69■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.69■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.68■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.68■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.68■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 FEZ1Q99689 392 aa15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 CDK19Q9BWU1 502 aa15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 PIK3R4Q99570 1358 aa15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 F13A1P00488 732 aa15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 RTL1A6NKG5 1358 aa15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 KIF1BO60333 1816 aa15.67■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 ANKRD7Q92527 254 aa15.66■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.66■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 AK2P54819 239 aa15.65■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 TCHHQ07283 1943 aa15.65■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 TAF3Q5VWG9 929 aa15.65■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 GJB2P29033 226 aa15.65■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.65■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.65■□□□□ 0.1
ITGA3-201ENST00000007722 TET3O43151 1660 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 GNAI2P04899 355 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 G2E3Q7L622 706 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 FBXW7Q969H0 707 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 CASTP20810 708 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 MAP3K11Q16584 847 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 SPG7Q9UQ90 795 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 NME9Q86XW9 330 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 TNMDQ9H2S6 317 aa15.64■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 SMTNL1A8MU46 457 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM51Q9NW97 253 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC66A2RUB6 948 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 ANAPC15P60006 121 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF853P0CG23 659 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 NECAB1Q8N987 351 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.63■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 ATP10DQ9P241 1426 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 ABCC1P33527 1531 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 TULP4Q9NRJ4 1543 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 IL25Q9H293 177 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 TYRO3Q06418 890 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 BICD2Q8TD16 824 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 RGS12O14924 1447 aa15.61■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 FAM135BQ49AJ0 1406 aa15.61■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 CEP135Q66GS9 1140 aa15.61■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.61■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.61■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 KRT222Q8N1A0 295 aa15.61■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.61■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 MROH2AA6NES4 1674 aa15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 LARGE1O95461 756 aa15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 STK31Q9BXU1 1019 aa15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 LIG1P18858 919 aa15.6■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.59■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.59■□□□□ 0.09
ITGA3-201ENST00000007722 ST7Q9NRC1 585 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms