Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms