Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COPS7AQ9UBW8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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