Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copg1Q9QZE5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms