Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
REREQ9P2R6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
REREQ9P2R6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
REREQ9P2R6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
REREQ9P2R6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
REREQ9P2R6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms