Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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