Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms