Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRG4Q92954 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRG4Q92954 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms