Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAAF3Q8N9W5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAAF3Q8N9W5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAAF3Q8N9W5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAAF3Q8N9W5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAAF3Q8N9W5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAAF3Q8N9W5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DNAAF3Q8N9W5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DNAAF3Q8N9W5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms