Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC2Q8N158 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC2Q8N158 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms