Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLX4Q8IY92 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms