Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP188Q5SRE5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP188Q5SRE5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms