Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ITSN1Q15811 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms