Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PDE7AQ13946 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms