Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SMARCA4P51532 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SMARCA4P51532 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms