Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNA7P36544 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms