Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPS1P31327 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPS1P31327 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPS1P31327 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPS1P31327 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPS1P31327 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPS1P31327 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPS1P31327 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPS1P31327 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPS1P31327 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms